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BUNSEN本生分享:pcr实验原理及详细操作步骤

更新时间:2026-08-21  |  点击率:28

BUNSEN本生分享:pcr实验原理及详细操作步骤


PCR(聚合酶链反应)是一种体外特异性扩增目标DNA片段的分子生物学技术,可在数小时内将微量靶序列扩增数百万倍,是分子生物学领域的基础实验技术。以下是BUNSEN本生整理的PCR实验原理及详细操作步骤:

一、PCR实验原理

PCR的本质是模拟生物体内的DNA半保留复制过程,通过‌温度循环控制‌实现目标DNA的指数级扩增,依赖三个关键反应步骤循环往复完成。

变性阶段‌:反应体系加热至94-96℃,维持30秒,使双链DNA的氢键断裂,解离为两条单链DNA,为引物结合提供模板。

退火阶段‌:体系降温至55-65℃,维持30秒,人工合成的上下游特异性引物按碱基互补配对原则,与单链模板DNA的靶序列两端精准结合。

延伸阶段‌:体系升温至72℃(Taq酶最适活性温度),DNA聚合酶以dNTP为原料,从引物的3‘端开始沿5’→3‘方向合成新的互补DNA链。

扩增逻辑‌:每完成一次变性~退火~延伸循环,目标DNA片段的拷贝数就翻倍,经过25-40次循环后,靶序列可实现数百万倍的指数级扩增。

二、实验前准备工作

1.试剂与器材清单

试剂‌:DNA模板、上下游特异性引物、Taq DNA聚合酶、dNTP混合物、含Mg²⁺的10×PCR缓冲液、灭菌超纯水,也可直接使用预混好的2×PCR Mix简化操作。

器材‌:不同量程的移液枪及对应无菌枪头、0.2ml PCR管/8联排管、低温金属冰盒、小型桌面离心机、PCR仪。

2. 25μL标准反应体系配制

按从水到模板的顺序在冰上操作,避免交叉污染,各组分用量如下:

2×PCR Mix:12.5μL(已预混dNTP、Mg²⁺和Taq酶)

10μM上游引物:0.5μL

10μM下游引物:0.5μL

DNA模板:1-3μL(总DNA量控制在10-100ng)

灭菌超纯水:补足至总体积25μL

3.加样关键注意事项

所有试剂全程置于冰上解冻,避免反复冻融导致活性失效。

模板DNA最后添加,添加不同样品模板时必须更换新枪头,防止交叉污染。

必须同步设置‌阴性对照(不加模板)‌和‌阳性对照‌,便于后续实验结果异常时快速排查问题。

三、PCR仪温度程序设置

完整程序分为4个阶段,参数可根据引物Tm值、目的片段长度灵活调整:

预变性‌:95℃保温4-5分钟,确保模板DNA双链解开,消除复杂二级结构对扩增的干扰。

循环阶段‌:重复25-40次标准三步骤循环:94℃变性30秒→ 55-65℃退火30秒→ 72℃延伸(延伸时长按1kb/分钟计算)。

终延伸‌:72℃保温5-10分钟,让所有扩增产物的3’端补平A尾,保证片段完整。

低温保存‌:程序结束后设置4℃恒温,可短期暂存扩增产物。

四、扩增产物电泳检测

通过琼脂糖凝胶电泳验证扩增结果,操作步骤如下:

配制1-2%浓度的琼脂糖凝胶:称取对应质量的琼脂糖溶于1×TAE缓冲液,微波炉加热至溶解,冷却至55℃左右加入核酸染料,倒入制胶槽插梳静置凝固。

点样与电泳:取5μL PCR产物与上样缓冲液混合后点入凝胶孔,同时加入DNA Marker作为分子量参照,设置120V恒压电泳20-30分钟。

结果判读:将凝胶放入凝胶成像系统,在紫外光下观察条带,条带位置与预期片段大小一致即为扩增成功。

五、常见问题快速排查

无扩增条带‌:检查模板是否降解、Taq酶是否失活,适当延长预变性时间、降低退火温度重新尝试。

非特异性杂带多‌:重新优化引物设计,适当提高退火温度、减少2-3个循环次数,降低Taq酶用量。

大量引物二聚体‌:将引物终浓度调整至0.1-0.3μM,更换热启动Taq酶减少低温下的非特异性结合。

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